产品货号:
YTB4131
中文名称:
核酸内切酶VIII
英文名称:
Endonuclease VIII
产品规格:
1kU|5kU|20kU
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本核酸内切酶VIII来自大肠杆菌,是表达、纯化获得的重组内切酶。核酸内切酶VIII是一种DNA损伤修复酶,具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。核酸内切酶VIII的N-糖基化酶活性能切下并释放双链DNA上受损的嘧啶碱基(Pyrimidines)从而产生一个脱嘌呤(Apurinic,AP)位点;核酸内切酶VIII的AP裂解酶活性,可以切割AP位点的3'和5'端,从而切除AP位点,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。
核酸内切酶VIII可以识别并切除的受损碱基包括:Urea、5,6-dihydroxythymine (5,6-二羟基胸腺嘧啶)、Thymine glycol (胸腺嘧啶乙二醇)、5-hydroxy-5-methylhydantoin (5-羟基-5-甲内酰脲)、Uracil glycol (尿嘧啶乙二醇)、6-hydroxy-5,6-dihydrothymine (6-羟基-5,6-二氢胸腺嘧啶)和Methyltartronylurea (甲基羟丙二酰脲)。虽然核酸内切酶VIII与Endonuclease III相似,但核酸内切酶VIII具有β和δ裂解酶活性,而Endonuclease III仅具有β裂解酶活性。
可用于DNA损伤和修复研究;单细胞凝胶电泳;碱洗脱;碱解螺旋;识别并切除双链DNA上受损的嘧啶碱基;切割AP位点的3'和5'端而产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口(Gap)。
本制品识别并切除双链DNA上受损碱基的原理请参考图1。
图1.核酸内切酶VIII识别并切除双链DNA上受损碱基的示意图。核酸内切酶VIII识别双链DNA上受损碱基并在其N-糖基化酶活性作用下切除双链DNA上受损的嘧啶碱基,产生一个脱嘌呤(AP)位点;随后在其AP裂解酶活性作用下切割AP位点的3'和5'端切除AP位点,产生一个具有3'和5'磷酸的碱基缺口。
核酸内切酶VIII催化酶切含AP位点双链DNA的效果请参考图2。
图2.本制品和国外N公司的同类产品催化切除含AP位点双链DNA的效果图。在20μL反应体系中加入图中指定量的本制品或N公司的核酸内切酶VIII,37℃孵育30分钟进行损伤位点切除反应,反应完毕后立即放至冰上,并加入2×RNA上样缓冲液(货号:YTB0215),随后用TBE-Urea PAGE预制胶(15%)进行电泳分析,最终进行核酸染色和荧光成像分析。如图所示,本制品与N公司的竞品相比,具有类似的催化效果。反应体系(20μL):10mM Tris-HCl,75mM NaCl,1mM EDTA,pH8@25℃,20pmol含AP位点的双链DNA以及不同浓度的核酸内切酶VIII。含AP位点的双链DNA的制备方法:将含dU碱基的DNA 1 (31nt)和正常的DNA 2 (27nt)按照DNA寡核苷酸退火缓冲液(货号:YT483)说明书中的使用方法通过梯度降温退火形成双链DNA;随后使用UDG酶(货号:YTB4034)/细菌热敏型UDG酶(货号:YTB4035)/鳕鱼热敏型UDG酶(货号:YTB4036)催化含尿嘧啶的DNA链中的尿嘧啶(dU)碱基和脱氧核糖之间的N-糖苷键发生水解,从而释放游离尿嘧啶产生含AP位点的双链DNA。实际检测效果会因实验条件、检测仪器等的不同而存在差异,图中数据仅供参考。
组分 | 1kU | 5kU | 20kU |
核酸内切酶VIII(10U/μL) | 100μL | 500μL | 2mL |
10×Endo VIII Buffer | 400μL | 2mL | 8mL |
保存:-20℃,有效期2年。
10mM Tris-HCl,250mM NaCl,0.1mM EDTA,1mM DTT,50% (v/v) Glycerol,pH8.0@25℃。
10×Endo VIII Buffer:
100mM Tris-HCl,750mM NaCl,10mM EDTA,pH8.0@25℃。
大于95%,无DNA内切酶和其他外切酶活性,无RNA酶活性。
75℃加热10分钟可使核酸内切酶VIII失活。
- 本制品中在使用时宜存放在冰盒内或冰浴上,使用完毕后宜立即放置于-20℃保存。
- 本制品仅限于专业人员的科学研究用,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品。
- 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
- 使用核酸内切酶VIII切除双链DNA中的AP位点
- 双链DNA的制备:使用DNA寡核苷酸退火缓冲液(货号:YT483)使单链DNA (中间含有一个或多个脱氧尿嘧啶碱基)和其互补链DNA (中间不含有脱氧尿嘧啶碱基)退火形成双链DNA。
- 含AP位点双链DNA的制备:使用UDG酶/细菌热敏型UDG酶/鳕鱼热敏型UDG酶处理退火双链DNA,生成含有AP位点的双链DNA。
- 切除双链DNA中的含AP位点的:
- 参考下表在冰浴中配制反应体系。
成分 用量 无菌无酶超纯水 15μL 10×Endo VIII Buffer 2μL dsDNA with AP site(10μM/μL) 2μL 核酸内切酶VIII(10U/μL) 1μL
注:请把除核酸内切酶VIII以外的组分充分混匀后再加入核酸内切酶VIII,加入核酸内切酶VIII后可以用移液器吹打混匀。如果待酶切DNA量较大,可以适当延长酶切时间或按比例放大酶切体系。 - 反应条件:37℃,30分钟。
- 终止反应:75℃加热10分钟,或者冰浴孵育1~2分钟并加入2×RNA上样缓冲液(货号:YTB0215)。
- 参考下表在冰浴中配制反应体系。
- 双链DNA的制备:使用DNA寡核苷酸退火缓冲液(货号:YT483)使单链DNA (中间含有一个或多个脱氧尿嘧啶碱基)和其互补链DNA (中间不含有脱氧尿嘧啶碱基)退火形成双链DNA。
- 其它应用请参考相关文献进行。
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